Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZCCHC2Q9C0B9 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms