Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP1Q9C000 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms