Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms