Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCAPERQ9BY12 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCAPERQ9BY12 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms