Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PACSIN1Q9BY11 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms