Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC106Q9BWC9 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms