Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms