Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms