Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFHD1Q9BUP0 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms