Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSB4

ATG101, Autophagy-related protein 101, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG101Q9BSB4 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATG101Q9BSB4 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATG101Q9BSB4 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATG101Q9BSB4 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATG101Q9BSB4 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATG101Q9BSB4 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATG101Q9BSB4 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATG101Q9BSB4 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATG101Q9BSB4 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATG101Q9BSB4 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATG101Q9BSB4 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATG101Q9BSB4 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATG101Q9BSB4 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ATG101Q9BSB4 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATG101Q9BSB4 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATG101Q9BSB4 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATG101Q9BSB4 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATG101Q9BSB4 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATG101Q9BSB4 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATG101Q9BSB4 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATG101Q9BSB4 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATG101Q9BSB4 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATG101Q9BSB4 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATG101Q9BSB4 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATG101Q9BSB4 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATG101Q9BSB4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATG101Q9BSB4 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATG101Q9BSB4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATG101Q9BSB4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ATG101Q9BSB4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATG101Q9BSB4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATG101Q9BSB4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATG101Q9BSB4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATG101Q9BSB4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATG101Q9BSB4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATG101Q9BSB4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATG101Q9BSB4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATG101Q9BSB4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATG101Q9BSB4 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATG101Q9BSB4 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATG101Q9BSB4 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATG101Q9BSB4 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATG101Q9BSB4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATG101Q9BSB4 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATG101Q9BSB4 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATG101Q9BSB4 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATG101Q9BSB4 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATG101Q9BSB4 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATG101Q9BSB4 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATG101Q9BSB4 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATG101Q9BSB4 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATG101Q9BSB4 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATG101Q9BSB4 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
ATG101Q9BSB4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
ATG101Q9BSB4 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
ATG101Q9BSB4 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
ATG101Q9BSB4 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
ATG101Q9BSB4 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
ATG101Q9BSB4 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG101Q9BSB4 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG101Q9BSB4 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG101Q9BSB4 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG101Q9BSB4 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG101Q9BSB4 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG101Q9BSB4 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG101Q9BSB4 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG101Q9BSB4 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG101Q9BSB4 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG101Q9BSB4 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG101Q9BSB4 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG101Q9BSB4 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG101Q9BSB4 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG101Q9BSB4 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG101Q9BSB4 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG101Q9BSB4 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG101Q9BSB4 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG101Q9BSB4 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG101Q9BSB4 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG101Q9BSB4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG101Q9BSB4 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG101Q9BSB4 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG101Q9BSB4 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG101Q9BSB4 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG101Q9BSB4 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG101Q9BSB4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG101Q9BSB4 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG101Q9BSB4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG101Q9BSB4 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG101Q9BSB4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG101Q9BSB4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG101Q9BSB4 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG101Q9BSB4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG101Q9BSB4 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG101Q9BSB4 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG101Q9BSB4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG101Q9BSB4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG101Q9BSB4 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG101Q9BSB4 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG101Q9BSB4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATG101Q9BSB4 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms