Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BPIFA3Q9BQP9 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BPIFA3Q9BQP9 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms