Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3CQ99985 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms