Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms