Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

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Length 1,192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKP4Q99569 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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