Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP88Q99567 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms