Protein–RNA interactions for Protein: Q96S82

UBL7, Ubiquitin-like protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL7Q96S82 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBL7Q96S82 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms