Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms