Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIRT1Q96EB6 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms