Protein–RNA interactions for Protein: Q96A56

TP53INP1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53INP1Q96A56 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TP53INP1Q96A56 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms