Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMARCE1Q969G3 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms