Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
UBXN4Q92575 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms