Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TOPBP1Q92547 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TOPBP1Q92547 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms