Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms