Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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ZNF548Q8NEK5 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF548Q8NEK5 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
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