Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZIC4Q8N9L1 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZIC4Q8N9L1 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZIC4Q8N9L1 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZIC4Q8N9L1 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZIC4Q8N9L1 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZIC4Q8N9L1 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZIC4Q8N9L1 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZIC4Q8N9L1 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZIC4Q8N9L1 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZIC4Q8N9L1 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZIC4Q8N9L1 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
ZIC4Q8N9L1 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZIC4Q8N9L1 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
ZIC4Q8N9L1 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZIC4Q8N9L1 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZIC4Q8N9L1 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZIC4Q8N9L1 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZIC4Q8N9L1 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZIC4Q8N9L1 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZIC4Q8N9L1 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZIC4Q8N9L1 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZIC4Q8N9L1 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZIC4Q8N9L1 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZIC4Q8N9L1 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
ZIC4Q8N9L1 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZIC4Q8N9L1 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZIC4Q8N9L1 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZIC4Q8N9L1 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZIC4Q8N9L1 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZIC4Q8N9L1 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZIC4Q8N9L1 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZIC4Q8N9L1 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZIC4Q8N9L1 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZIC4Q8N9L1 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZIC4Q8N9L1 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZIC4Q8N9L1 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZIC4Q8N9L1 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZIC4Q8N9L1 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZIC4Q8N9L1 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZIC4Q8N9L1 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZIC4Q8N9L1 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZIC4Q8N9L1 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZIC4Q8N9L1 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZIC4Q8N9L1 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZIC4Q8N9L1 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZIC4Q8N9L1 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZIC4Q8N9L1 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZIC4Q8N9L1 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZIC4Q8N9L1 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZIC4Q8N9L1 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZIC4Q8N9L1 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZIC4Q8N9L1 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZIC4Q8N9L1 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZIC4Q8N9L1 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZIC4Q8N9L1 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZIC4Q8N9L1 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZIC4Q8N9L1 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZIC4Q8N9L1 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZIC4Q8N9L1 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZIC4Q8N9L1 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZIC4Q8N9L1 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZIC4Q8N9L1 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZIC4Q8N9L1 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZIC4Q8N9L1 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZIC4Q8N9L1 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZIC4Q8N9L1 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZIC4Q8N9L1 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZIC4Q8N9L1 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZIC4Q8N9L1 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZIC4Q8N9L1 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZIC4Q8N9L1 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZIC4Q8N9L1 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZIC4Q8N9L1 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZIC4Q8N9L1 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZIC4Q8N9L1 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZIC4Q8N9L1 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZIC4Q8N9L1 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ZIC4Q8N9L1 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ZIC4Q8N9L1 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZIC4Q8N9L1 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZIC4Q8N9L1 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZIC4Q8N9L1 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZIC4Q8N9L1 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZIC4Q8N9L1 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZIC4Q8N9L1 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZIC4Q8N9L1 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZIC4Q8N9L1 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZIC4Q8N9L1 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZIC4Q8N9L1 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZIC4Q8N9L1 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZIC4Q8N9L1 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZIC4Q8N9L1 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZIC4Q8N9L1 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZIC4Q8N9L1 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZIC4Q8N9L1 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZIC4Q8N9L1 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZIC4Q8N9L1 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZIC4Q8N9L1 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZIC4Q8N9L1 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms