Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.5 ms