Protein–RNA interactions for Protein: Q86X40

LRRC28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC28Q86X40 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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