Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HAPLN4Q86UW8 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms