Protein–RNA interactions for Protein: Q86T20

SMIM29, Uncharacterized protein SMIM29, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM29Q86T20 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms