Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z460

CLASP1, CLIP-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLASP1Q7Z460 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLASP1Q7Z460 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLASP1Q7Z460 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLASP1Q7Z460 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLASP1Q7Z460 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLASP1Q7Z460 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CLASP1Q7Z460 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms