Protein–RNA interactions for Protein: Q6VVB1

NHLRC1, E3 ubiquitin-protein ligase NHLRC1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC1Q6VVB1 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NHLRC1Q6VVB1 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NHLRC1Q6VVB1 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NHLRC1Q6VVB1 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NHLRC1Q6VVB1 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NHLRC1Q6VVB1 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NHLRC1Q6VVB1 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NHLRC1Q6VVB1 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NHLRC1Q6VVB1 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NHLRC1Q6VVB1 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NHLRC1Q6VVB1 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NHLRC1Q6VVB1 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NHLRC1Q6VVB1 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NHLRC1Q6VVB1 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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NHLRC1Q6VVB1 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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NHLRC1Q6VVB1 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NHLRC1Q6VVB1 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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