Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCBE1Q6UXH8 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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