Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSSK4Q6SA08 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms