Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ZBED9Q6R2W3 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
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