Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZCCHC12Q6PEW1 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms