Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMBOX1Q6NT76 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms