Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATG9BQ674R7 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms