Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms