Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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