Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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RTL8BQ17RB0 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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