Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM187BQ17R55 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms