Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms