Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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ECM1Q16610 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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ECM1Q16610 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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ECM1Q16610 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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ECM1Q16610 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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ECM1Q16610 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
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ECM1Q16610 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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ECM1Q16610 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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ECM1Q16610 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
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ECM1Q16610 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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