Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SSX1Q16384 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SSX1Q16384 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SSX1Q16384 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SSX1Q16384 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SSX1Q16384 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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