Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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