Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COL19A1Q14993 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
COL19A1Q14993 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms