Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMC1AQ14683 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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