Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
FHL3Q13643 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms