Protein–RNA interactions for Protein: Q13630

TSTA3, GDP-L-fucose synthase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3Q13630 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSTA3Q13630 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TSTA3Q13630 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSTA3Q13630 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSTA3Q13630 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSTA3Q13630 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSTA3Q13630 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSTA3Q13630 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSTA3Q13630 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSTA3Q13630 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSTA3Q13630 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSTA3Q13630 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSTA3Q13630 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSTA3Q13630 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSTA3Q13630 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSTA3Q13630 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSTA3Q13630 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSTA3Q13630 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSTA3Q13630 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSTA3Q13630 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSTA3Q13630 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
TSTA3Q13630 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSTA3Q13630 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSTA3Q13630 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSTA3Q13630 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSTA3Q13630 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms