Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL4BQ13620 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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